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Bactéries pathogènes pour l'homme :
- Afipia felis >>> maladie des griffes du chat 
- Bacillus anthracis >>> charbon (anthrax)
- Bacillus cereus >>> intoxication alimentaire à Bacillus cereus
- Bartonella henselae, clarridgeiae >>> maladie des griffes du chat
- Bordetella pertussis (bacille de Bordet et Gengou) >>> coqueluche
- Bordetella parapertussis et bronchiseptica >>> syndrômes parapertussiques bénins
- Borrelia burgdorferi >>> maladie de Lyme
- Borrelia recurrentis >>> borrelioses (fièvres récurrentes transmises par les poux)
- Borrelia hispanica, persica, duttonii, crocidurae >>> borrelioses (fièvres récurrentes transmises par les tiques)
- Brucella melitensis, abortus, suis >>> brucellose
- Burkholderia mallei >>> morve
- Burkholderia pseudomallei (bacille de Whitmore) >>> mélioïdose
- Campylobacter fetus ssp. fetus >>> campylobactériose
- Campylobacter jejuni >>> entérites
- Chlamydia trachomatis >>> trachome - maladie de Nicolas et Favre (lymphogranulome vénérien)
- Chlamydophila pneumoniae >>> infections respiratoires
- Chlamydophila psittaci >>> ornithose-psittacose
- Clostridium botulinum >>> botulisme
- Clostridium difficile >>> colites pseudo-membraneuses
- Clostridium perfringens >>> gangrènes gazeuses
- Clostridium tetani >>> tétanos
- Corynebacterium diphteriae >>> diphtérie
- Coxiella burnetii >>> fièvre Q
- Ehrlichia chaffeensis >>> ehrlichiose monocytaire humaine
- Ehrlichia equi, phagocytophila >>> ehrlichiose granulocytaire humaine
- Erysipelothrix rhusiopathiae >>> érysipéloïde
- Escherichia coli >>> entérites
- Francisella tularensis >>> tularémie
- Haemophilus ducreyi >>> chancre mou
- Haemophilus influenzae >>> méningite bactérienne
- Helicobacter pylori >>> ulcère gastro-duodénal
- Legionella pneumophila >>> légionellose
- Leptospira interrogans >>> leptospirose ictéro-hémorragique
- Listeria monocytogenes >>> listeriose
- Mycobacterium leprae (bacille de Hansen) >>> lèpre
- Mycobacterium tuberculosis (bacille de Koch) >>> tuberculose
- Mycobactéries atypiques (avium, bovis, intracellulare...) >>>
- Mycoplasma pneumoniae >>> pneumonie atypique primitive
- Mycoplasma hominis >>> infections uro-génitales
- Neisseria gonorrhoeae (gonocoque) >>> blennoragie
- Neisseria meningitidis (méningocoque) >>> méningite cérébro-spinale à méningocoques
- Pasteurella multocida >>> pasteurellose
- Pseudomonas aeruginosa (bacille pyocyanique) >>> Infections opportunistes et nosocomiales
- Rickettsia (nombreuses espèces) >>> typhus et fièvres exanthématiques
- Salmonella enterica >>> salmonelloses
- Shigella dysenteriae, S. flexneri, S. boydii et S. sonnei >>> dysentérie bacillaire
- Spirillum minus >>> sodoku
- Staphylocoques et streptocoques >>> impetigo
- Streptocoques du groupe A >>> scarlatine, erysipèle
- Streptococcus pneumoniae >>> infections de la sphère ORL, pneumonies...
- Treponema pallidum >>> syphilis
- Tropheryma whipplei >>> maladie de Whipple (lipodystrophie intestinale)
- Ureaplasma urealyticum >>> infections uro-génitales
- Vibrio cholerae (variétés cholerae et eltor) >>> choléra
- Yersinia pestis >>> peste
- Yersinia enterocolitica >>> entéro-colite
- Yersinia pseudotuberculosis >>> pseudotuberculose
NB : la classification bactérienne présentée ici reflète les recommendations du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd edition.
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