Examen 1 :
DEUG SVTE (deuxième année) - option Biochimie Expérimentale - Université d'Aix-Marseille I - Juin 1999.
Durée conseillée : 30 minutes - 1 heure.
Une enzyme de masse moléculaire 70000, présente dans le cerveau de rat, est purifiée en deux étapes de chromatographie, à partir d'un extrait brut de 25 g de protéines. Cet extrait présente une activité enzymatique spécifique de 400 UE / g de protéines.
- Etape 1 :
La première étape consiste en une chromatographie d'exclusion sur colonne : les 25 g de protéines sont repris dans un tampon à pH 7,4 puis déposés sur la colonne à un temps zéro. A partir de ce moment, on recueille en sortie de colonne des fractions éluées de 5 ml dans lesquelles on dose l'activité enzymatique. Le résultat des dosages est donné ci-dessous, ainsi que la concentration protéique de chaque fraction :
| n° de la fraction : |
AE (UE/ml) : |
concentration protéique (mg/ml) : |
| 1 |
4 |
420 |
| 2 |
37 |
540 |
| 3 |
328 |
480 |
| 4 |
1256 |
570 |
| 5 |
216 |
420 |
| 6 |
23 |
280 |
| 7 |
2 |
250 |
AE : activité enzymatique. UE : nombre d'unités enzymatiques.
Les trois fractions contenant majoritairement l'enzyme d'intérêt sont recueillies et mélangées.
- Etape 2 :
Le mélange des trois fractions (pH 7,4) est déposé sur une colonne contenant une résine échangeuse d'ions, qui va permettre la deuxième étape de purification de l'enzyme (pHi de l'enzyme = 9,6). Au cours de l'élution, des fractions de 5 ml sont récoltées et l'activité enzymatique est dosée dans chacune de ces fractions (voir tableau ci-après).
| n° de la fraction : |
AE (UE/ml) : |
| 1 |
1 |
| 2 |
3 |
| 3 |
2 |
| 4 |
2 |
| 5 |
8 |
| 6 |
982 |
| 7 |
12 |
La fraction n° 6 est récupérée et la densité optique à 260 nm est mesurée sur cette fraction : DO260 nm = 0,740. La valeur du coefficient d'extinction molaire pour l'enzyme est :
e = 115 M
-1 . cm
-1. La longueur de la cuve est 1 cm. (On considérera pour les calculs que l'enzyme est pure.)
Vous répondrez aux questions sur la feuille suivante, que vous mettrez dans votre copie d'examen.
Correction
| Nom : .............................. |
Prénom : ............................................. |
Questions :
1 - A l'issue de la chromatographie d'exclusion (étape 1), quelles sont les trois fractions que l'on mélange ? Calculer le nombre total d'UE recueilli, ainsi que la quantité totale de protéines. Quel est le volume d'élution de l'enzyme ?
- Fractions :
- Nombre total d'UE recueilli :
- Quantité totale de protéines :
- Volume d'élution :
2 - Quel est le type d'ion que peut échanger la résine de l'étape 2 ? Justifier la réponse. Donner un exemple de groupement chimique pour une telle résine.
- Type d'échangeur d'ions :
- Exemple de groupement :
3 - A quel pH va être réalisée l'élution pour la chromatographie échangeuse d'ions ? Justifier la réponse. Quel est le volume d'élution de l'enzyme ?
- Volume d'élution :
4 - Déterminer le rendement de chacune des 2 étapes de purification, ainsi que le rendement global.
5 - Calculer la quantité de protéines récupérée après l'étape 2 (chromatographie d'échange d'ions). Quel est le taux de purification de l'enzyme à l'issue de chaque étape chromatographique ? Conclusion ?
(pour répondre aux questions 4 et 5, remplir le tableau ci-dessous :)
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protéines (g) : |
AE (UE) : |
rendement : |
taux de purification : |
| extrait : |
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| étape 1 : |
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| étape 2 : |
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- Rendement global :
- Conclusion (utiliser le verso de la feuille, si nécessaire).
Correction
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