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Le post-doc... et après ?
Annonces 6 à 10 :
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Référence : 010
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(24-09-2003)
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Séverine DEMART
226 route de Seysses
Bât. D - Appt 105
31100 Toulouse
Tél : 05 61 41 37 83
E-mail : severinedemart@hotmail.com
Age : 30 ans
Nationalité : française
Post-doctorat (2000-2003) à l’Institut de Virologie Moléculaire (Groupe du PD Dr. Ruth BRACK-WERNER), GSF-Centre national de recherches pour l’environnement et la santé GmbH, Neuherberg, Allemagne.
Sujet : Recherche de signaux spécifiques de la protéine Rev du virus VIH-1 responsables de son accumulation cytoplasmique dans les astrocytes (détails disponibles sur
le site Internet du laboratoire : http://www.gsf.de/imv/rv_regul/Severine.html).
Collaboration en 2003 avec l'entreprise Carl Zeiss dans le cadre du développement d’un nouveau microscope inversé permettant l’observation de cellules
vivantes.
Doctorat de Biologie du Vieillissement (soutenance fin 1999) au service de Neurovirologie (Directeur : Pr. Dominique DORMONT), Direction des Sciences du
Vivant, Département de recherche médicale, Commissariat à l’Energie Atomique, Fontenay-aux-Roses, France/Université René Descartes, Paris V, France.
Sujet : Thérapeutique expérimentale des encéphalopathies subaiguës spongiformes transmissibles et mise en place d’un modèle in vitro de cellules surexprimant la
protéine du prion (PrP).
Formations complémentaires :
2002 : Formation en radioprotection (en langue allemande), Neuherberg, Allemagne.
1998 : Certificat d’aptitude à l’expérimentation animale, Maisons-Alfort, France.
Compétences :
Techniques : Biologie moléculaire (clonage, PCR, RT-PCR), biochimie (Western blot, test d’anticorps monoclonaux), biologiecellulaire (transfection, microscopie sur
cellules vivantes et fixées, immunofluorescence, quantification de la fluorescence), expérimentation animale (immunisations de souris et de lapins, traitements intra-
péritonéaux de hamsters et de souris et prélèvements d’organes en vue d’études biochimiques).
Encadrement : Encadrement d'un étudiant en DEA pendant 8 mois, et de plusieurs étudiants une semaine par an dans le cadre de leurs travaux pratiques au laboratoire.
Informatique : Macintosh et PC, Word, Endnote, Excel, PowerPoint, Adobe Photoshop, Adobe Illustrator, IPLab, GraphPad PRISM, Axiovision, Gene construction kit,
Sequencher.
Langues : Anglais : technique et courant., Allemand : technique et courant.
Prix scientifique :
Second prix de la fondation de Gérontologie et des laboratoires Servier pour le mémoire de DEA.
Publications :
Demart S., Ceccherini-Silberstein F., Schlicht S., Walcher S., Wolff H., Neumann M., Erfle V., and Brack-Werner R.. Analysis of nuclear targeting activities of
transport signals in the human immunodeficiency virus Rev protein. 2003. Exp. Cell Res. In press.
Demart S., Fournier J.-G., Creminon C., Frobert Y., Lamoury F., Marcé D., Lasmézas C., Dormont D., Grassi J., & Deslys J.-P., New insight into abnormal prion protein using monoclonal antibodies. 1999. Biochem. Biophys. Res. Comm. 265 : 652-657.
Adjou K. T., Privat N., Demart S., Deslys J.-P., Seman M., Hauw J.-J. & Dormont D. MS-8209, an amphotericin B analogue, delays the appearance of
spongiosis, astrogliosis and PrPres accumulation in the brain of scrapie-infected hamsters. 2000. J. Comp. Pathol. 122 : 3-8.
Demaimay R., Adjou K. T., Beringue V., Demart S., Lasmézas C. I., Deslys J.-P., Seman M. & Dormont D. Late treatment with polyene antibiotics can prolong the survival time of scrapie infected animals. 1997. J. Virol. 71 : 9685-9689.
Adjou K. T., Demaimay R., Deslys J.-P., Lamézas C. I., Beringue V., Demart S., Lamoury F., Seman M. & Dormont D. MS-8209, a water-soluble amphotericin B derivative affects both scrapie agent replication and PrP-res accumulation in Syrian hamster scrapie. 1998. J. Gen. Virol. 80 (Pt4) : 1079-85.
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Référence : 009
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(26-08-2003)
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Jean-Guy BERRIN
né le 05/06/74 Nationalité Française - Marié
32, Avenue Foch - 13004 Marseille (France)
Tél : +33 (0)4 91 34 92 60
E-mail : BERRIN@dsvsud.cea.fr
Expériences :
Depuis Janvier 2003, post-doctorant Laboratoire de Bioenergétique
Cellulaire
CEA Cadarache
« Rôle des NADH kinases dans le stress oxydant chez Arabidopsis
thaliana »
Ph.D en Nutrition (Décembre 2002) Institute of Food Research,
University of
East Anglia, Norwich, Angleterre (réalisé en co-tutelle entre la
Faculté des
Sciences, Université d'Aix-Marseille III). Bourse Européenne (Projet
POLYBIND) - Directeurs de thèse : Dr. Nathalie Juge / Prof. Gary
Williamson.
« Structure-activity relationships of a human cytosolic
beta-glucosidase »
DEA en Nutrition (1999) Laboratoire Biologie et Biochimie de la
Nutrition -
Faculté des Sciences, Université d'Aix-Marseille III.
« Expression de l'ADNc codant pour l'endo b-1,4 xylanase d'A. niger
chez
Pichia pastoris »
Compétences :
- Techniques : Biologie moléculaire (PCR, RT-PCR, Northern-blot,
clonage, expression hétérologue, mutagenèse dirigée...) ; Biochimie
(électrophorèses, Western-blot, dosage d'activités enzymatiques,
chromatographies, HPLC...) ; Microbiologie ; Biologie Cellulaire ;
Biologie
végétale
- Formations : Techniques d'analyses des antioxydants (Stage
européen, Pays-Bas); BBSRC courses (Norwich, UK) Technical writing,
Oral
presentation, Organisation skills, Bio-informatics.
- Nombreuses présentations orales - POLYBIND progress meetings.
- Enseignements : Travaux dirigés et Travaux Pratiques de
Biologie
moléculaire (Agrégation de génie biologique et biotechnologie,
Maîtrise de
Nutrition et Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie).
- Formation et encadrement de techniciens et d'étudiants de Licence
de
biologie cellulaire et physiologie et de Maîtrise de nutrition.
- Anglais : courant - Espagnol : notions.
Publications :
- Berrin, J.G., Czjzek M., Kroon P., McLauchlan, W. R.,
Puigserver, A., Williamson, G., and Juge, N. Substrate (aglycone)
specificity of human cytosolic b-glucosidase. Biochemical Journal 373
(1),
41-48 (2003).
- Nemeth, K., Plumb, G., Berrin, J.G., Juge, N, Jacob, R.,
Naim, H.Y., Williamson, G., Swallow, D., Kroon, P. Deglycosylation by
small
intestinal epithelial cell b-glucosidases is a critical step in the
absorption and metabolism of dietary flavonoid glycosides in humans.
European Journal of Nutrition 42 (1), 29-42 (2003).
- Tahir, T., Berrin, J.G., Flatman, R., Roepstorff, P.,
Williamson, G. and Juge, N. Specific characterisation of substrate
and
inhibitor binding sites of a glycosyl hydrolase family 11 from
Aspergillus
niger. Journal of Biological Chemistry 277 (46), 44035-44043 (2002).
- Flatman, R., McLauchlan, W. R., Juge, N., Furniss, C.,
Berrin, J.G., Hughes, R. K., Manzanares, P., Ladbury, J. and
Williamson, G.
Interactions defining the specificity between fungal xylanases and
the wheat
proteinaceous inhibitor, XIP-I. Biochemical Journal 365(3), 773-781
(2002).
- Berrin, J.G., Mclauchlan, W.R., Needs P., Williamson, G.,
Puigserver, A., Kroon P. and Juge, N. Functional expression of human
liver
cytosolic b-glucosidase in Pichia pastoris. European Journal of
Biochemistry
269(1), 249-258 (2002).
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Référence : 008
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(26-08-2003)
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RÉHAULT Sophie
Née le 11 mai 1975 à Rennes (35)
Nationalité française
201-8 Conner Drive
Chapel Hill, NC, 27514, USA
Téléphone : (919) 929-5415
Mél : srehault@med.unc.edu ou rehault@yahoo.fr
Disponibilité et mobilité : à partir de Janvier 2004, France
Position(s) recherchée(s) : CDD ou CDI comme chercheur dans une équipe de Recherche & Développement, Post-doctorat de courte durée (1 an à 1 an et demi) dans un laboratoire de Recherche
Domaine de Recherche souhaité : protéases et/ou inhibiteurs de protéases (serpines) associés aux cancers ou autres pathologies
Formation :
· Novembre 2001 : Doctorat en Biochimie, Mention Très Honorable avec Félicitations du jury, Université de Tours, France
Expériences professionnelles :
· Depuis Janvier 2002 : assistante de recherche postdoctorale dans le laboratoire d’Hématologie/Oncologie du Pr. Frank C. Church, Département de Pathologie, Université de Caroline du Nord à Chapel Hill, USA
Projet scientifique : Rôle des serpines dans le cancer de l’ovaire et du sein
· Octobre 1998-Novembre 2001 : étudiante en thèse dans le laboratoire d’Enzymologie et Chimie des Protéines INSERM EMI-U 00-10 (Directeur : Pr. Francis Gauthier)
Sujet de thèse : Etude fonctionnelle des kallicréines prostatiques humaines hK2 et hK3
· Décembre 1997-Septembre 1998 : Etudiante de D. E. A. dans le laboratoire d’Enzymologie et Chimie des Protéines, EA 2637 « Processus Infectieux et Tumoraux » (Directeur: Pr. Francis Gauthier)
Projet de D. E. A. : Conception de nouveaux substrats fluorogéniques de la cathepsine G, dérivés de la boucle réactive des serpines.
CHAMP DE COMPETENCES :
· Biologie moléculaire et cellulaire :
-expression de protéines recombinantes en système bactérien (E. coli)
-cultures cellulaires
-étude de l'expression d’ARN (purification d’ARN totaux, RT-PCR et PCR)
-clonage
-mutagénèse dirigée
· Biochimie : purification et caractérisation des propriétés biochimiques des protéines :
-chromatographies échangeuses d’ions, chromatographies d’exclusion, chromatographies d’affinité, HPLC
-techniques d’électrophorèse (SDS-PAGE, Western-blot, Western-ligand blot)
-enzymologie des protéases: titration des sites actifs des protéases, détermination des constantes cinétiques (Km, kcat, kcat/Km) grâce a l’utilisation de substrats chromogéniques, fluorogéniques et à extinction interne de fluorescence
· Anglais : bien maîtrisé, Espagnol: lu et parlé
· Informatique : logiciels de traitement de texte et d’image, tableurs (Word, Excel, Power Point, Acrobat, Photoshop…), Internet
· Autres : formation et encadrement d'étudiants, enseignement (50 heures de Travaux Pratiques de Biochimie, niveau Licence de Biochimie)
Publications :
1. Attucci S, Korkmaz B, Juliano L, Hazouard E, Girardin C, Brillard-Bourdet M, Rehault S, Anthonioz P, Gauthier F. 2002. Measurement of free and membrane-bound cathepsin G in human neutrophils using new sensitive fluorogenic substrates. Biochem J. 366(Pt 3):965-70.
2. Rehault S, Brillard-Bourdet M, Bourgeois L, Frenette G, Juliano L, Gauthier F, Moreau T. 2002. Design of new and sensitive fluorogenic substrates for human kallikrein hK3 (prostate-specific antigen) derived from semenogelin sequences. Biochim Biophys Acta.1596(1):55-62.
3. Brillard-Bourdet M, Rehault S, Juliano L, Ferrer M, Moreau T, Gauthier F. 2002. Amidolytic activity of prostatic acid phosphatase on human semenogelins and semenogelin-derived synthetic substrates. Eur J Biochem. 269(1):390-5
4. Rehault S, Monget P, Mazerbourg S, Tremblay R, Gutman N, Gauthier F, Moreau T. 2001. Insulin-like growth factor binding proteins (IGFBPs) as potential physiological substrates for human kallikreins hK2 and hK3. Eur J Biochem. 268(10):2960-8
5. Rehault S, Brillard-Bourdet M, Juliano MA, Juliano L, Gauthier F, Moreau T. 1999. New, sensitive fluorogenic substrates for human cathepsin G based on the sequence of serpin-reactive site loops. J Biol Chem. 274(20):13810-7
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Référence : 007
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(4-07-2003)
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AISSOUNI Youssef
Né le 24/03/62, nationalité Française
Résidence Valmante-Michelet, B1
109 traverse de la gouffonne
13009 Marseille Cedex 09
Tél : 0672220222
Mél : youssef.aissouni@free.fr / aissouni@cgm;cnrs-gif.fr
Chercheur contractuel dans le Centre de Génétique Moléculaire, CNRS,
Gif-sur-Yvette; France.
Domaine de recherche : "Sélection de ligands ARN (aptamères)
spécifiques des
marqueurs de surface des cellules tumorales et leur utilisation pour
la
détection des tumeurs in vivo par imagerie médicale."
Docteur, spécialité Biochimie (soutenue le 23/10/1993)
Laboratoire de thèse: laboratoire de biochimie des protéines, INSERM,
Montpellier
Sujet de thèse : Etude de l'Urate Oxydase d'Aspergillus flavus :
Recherche
et développement des méthodologies de mesure d¹activité et de
purification
pouvant être appliquée à l¹échelle industrielle
Post-doc (Institut de Karolinska, Suède) : Caractérisation et rôle
des
protéines hnRNP dans l¹assemblage des particules ribonucleoprotéiques
et le
transport intranucléaire
CDD-INSERM : laboratoire de cancérologie expérimentale; U119 INSERM;
Marseille : Etude des mécanismes impliqués dans la spécificité
cellulaire de
l¹épissage/polyadénylation alternatif du précurseur de la 2¹-5¹ Oligo
Adénylate Synthétase, une enzyme impliquée dans l¹effet antiviral
induit par
les interférons.
COMPETENCES :
BIOLOGIE MOLECULAIRE : préparation des vecteurs d'expression,
extraction
ADN/ARN, RT-PCR, PCR quantitative, RFLP, Southern-, Northern-,
Western-blot,
clonage, criblage de banques cDNA, mutagenèse dirigée, _expression
protéique, analyse de séquences nucléiques et protéiques par
programmes
informatiques, interrogation des banques de données
BIOCHIMIE : expression et purification des protéines recombinantes,
purification des protéines à partir des extraits : chromatographie
d¹affinité, chromatographie échangeuse d¹ions, dosage d¹activités
enzymatiques. Interaction acidenucléique-protéines, gel retard,
SELEX, FBA,
epissage, polyadénylation
BIOLOGIE CELLULAIRE : Culture des lignées cellulaires , transfection
transitoire, microdissection
Anglais : lu parlé et écrit
INFORMATIQUE : Traitement de texte, (Powerpoint, Adobe Photoshop),
Excel.
Clone manager, DNA-strider...
ENSEIGNEMENTS :
Département de biologie à l'université d'Evry :
- 1,5 heures de CM; licence SdV biologie cellulaire
- 36 heures de TD; DEUG-SdV 1ère année, Biologie cellulaire
- 16 heures de TP, DEUG-SdV2ème année Biochimie métabolique
- 16 heures de TP, IUP 1ère année Biochimie métabolique
Formation permanente à l'INSTN-CEA (Saclay) :
Enseignement en Biologie Moléculaire : 12 h CM, 18 h TD, 20 h TP.
PUBLICATIONS :
1-Aissouni Y., Perez C, Calmels B.and Benech P.D.(2002). J. Biol.
Chem.,
277, 35808-35814
2-Xin S., Visa N., Palka K., Zhao J., Shaobo J., Aissouni Y.
Alzhanova-Ericsson A.T. and Daneholt B (2002). Eur. J. Cell Biol.,
81,
125-137
3-Jonsson A. P., Aissouni Y., Palmberg C., Percipalle P., Nording E.,
Daneholt B., Jornvall H. and Bergman T.(2001). Anal. Chem., 70,
5370-5377
4-Miralles F., Ofverstedt L-O., Sabri N., Aissouni Y., Hellman U.,
Skoglund
U. and Visa N. (2000).J. Cell Biol. 148, 271-282.
5-Xin S., Alzhanova-Ericsson A.T., Visa N., Aissouni Y. Zhao J and
Daneholt
B (1998). J. Cell Biol., 142, 1181-1193
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Référence : 006
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(25-06-2003)
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Valéry MATARAZZO
Ph. D. Neurosciences
Né le : 05/03/1973
Nationalité : FRANCAISE
E-mail : vmatara1@jhmi.edu
Poste(s) souhaité(s) : Recherche / Laboratoire, Industrie
Disponibilité : 2004
Mobilité : France, Suisse
03/2001 : Doctorat de Neurosciences, Ecole doctorale des Sciences de la Vie Aix-Marseille.
EXPERIENCES :
- Depuis mai 2001 : Chercheur postdoctoral. Department of Neurosciences, Johns Hopkins School of Medicine, Baltimore, MD, USA.
Thématique neurogénèse et développement neuronal du système olfactif.
I - Fonction de la protéine LIF (Leukemia Inhibitor Factor) au cours de la différentiation neuronale.
II - Etudes du syndrome de Rett: effet de l’absence du gène MeCP2 sur la neurogénèse, la mort neuronale, la différentiation neuronale et de la connection des neurones olfactifs avec le bulbe olfactif.
- 1997-2001 : Doctorant. Laboratoire de Neurobiologie, CNRS-UPR 9024, Marseille, France.
Thématique réception du signal olfactif : I - Etude de l’interaction entre Récepteurs Olfactifs (OR) et proteines de liaison des odorants (OBP). II - Etude de l’interaction entre OR et odorants. Mise en place d’un systéme d’expression d’OR et de protéine-G en cellules d’insectes pour le criblage de banques d’odorants.
- 1996-1997 : Stage DEA. Laboratoire de Neurobiologie, CNRS-UPR 9024, Marseille, France.
Thématique identification de nouveaux Récepteurs Olfactifs (OR) chez les mammifères : Clonage de nouveaux OR chez la marmotte alpine et le porc. Phylogénie des OR chez les vertébrés.
COMPETENCES :
Biologie Moléculaire : RT-PCR et PCR en temps réel/semi-quantitative; étiquetage de cDNA par fusion ; clonage; simple et double recombinaison dans Baculovirus.
Biologie Cellulaire : culture de lignéee cellulaire de mammifères et transfection transitoire/stable; culture de lignée cellulaire d’insecte et infection virale, culture dissociée et primoculture de neurones; immunohysto(-cyto)logie; BrDU après injection in vivo; TUNEL; Hybridation in situ;
Biochimie : gel de protéines à 2 dimensions et Protéomique; immunoblot; radiomarquage à l’iode125 de peptides; expérience de compétition de liaison ligand/récepteur;
Imagerie Cellulaire : imagerie calcique en temps réel, microscopie à fluorescence et confocale;
Expérimentation animale : suivi de souris transgénique, fixation tissulaire par perfusion intra-cardiaque de l’embryon à l’adulte; dissections et coupes histologiques de cerveau; lésion chimique de l’épithélium olfactif; bulbectomie.
Langues : Très bonne maitrise de l’anglais ; notions d’espagnol
Informatique : PC et Mac; logiciels de bio-informatique (analyses nucleiques, protéiques), de statistique (Prism, Statview); de bibliographie (End Note) et d’imagerie (Photoshop/Illustrator, Canvas)
Enseignements : Ecole d’Ingénieur des Sciences de Luminy (ESIL); Université d’Aix-Marseille. Total volume horaire: 31 heures TD, 40 heures TP.
BREVETS :
1 - Brevet CNRS-INRA; Inventeurs: Ronin C., Devauchelle G., Cerruti M., Demaille J. and Matarazzo V. Expression de récepteurs à 7 domaines transmembraniares en système baculovirus/cellules d’insectes. Brevet français d’invention. Numéro de priorité: FR0209377, date de priorité: 24.07.2002.
2 - Brevet CNRS; Inventeurs: Clement J.L., Tirard A., Renucci M., Belaich A. and Matarazzo V. Nouveaux récepteurs et leurs utilisations – Brevet mondial d’invention - Numéro de publication: EP1090119 (WO9967282), date de publication: 11.04.2001.
PUBLICATIONS :
1 - D. Cohen*, V. Matarazzo*, A.M. Palmer, Y. Tu, O.E. Jeon, J. Pevsner and G.V. Ronnett. Expression of MeCP2 in olfactory receptor neurons is developmentally regulated and occurs before synaptogenesis. Mol. Cell. Neurosci. 22, 417-429, 2003 (*contribution équivalente)
2 - V. Matarazzo, N. Zsürger, J.C. Guillemot, O. Clot-Faybesse, J.M. Botto, C. Dal Farra, M. Crowe, J. Demaille, J.P. Vincent, J. Mazella and C. Ronin. Porcine Odorant-Binding Protein differentially binds to human olfactory receptors. Chem. Senses 27, 691-701, 2002.
3 - Moon C*., Yoo J.Y*., Matarazzo V., Sung Y.K., Kim E.J., Ronnett G.V. Leukemia inhibitory factor inhibits neuronal terminal differentiation through STAT3 activation. Proc. Natl. Acad. Sci. 99(13), 9015-20, 2002. (*contribution équivalente)
4 - Matarazzo V., Tirard A., Renucci M., Botto J.M., Bel M.C., Claverie J.M., Belaïch A., and J.L. Clement. Identification of odorant receptors from the Alpine Marmot (Marmota marmota). Cell. Mol. Biol. 46 (7), 1249-1258, 2000.
5 - Matarazzo Valéry, Tirard Alain, Renucci Marielle, Belaïch Anne, Clément Jean-Luc. Isolation of putative olfactory receptor sequences from pig nasal epithelium. Neurosci. Lett. 249, 87-90, 1998.
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